Zemitz er beliggende omkring syv kilometer syd for Wolgast og syv kilometer nord for Lassan. I kommunen ligger ud over Zemitz, landsbyerne Bauer, Hohensee, Seckeritz og Wehrland. Mod øst grænser kommunen op til Peenestrom.
Vandløbet Brebowbach løber gennem kommunen og videre til Peenestrom. Eneste nævneværdige sø i kommunen er den ca. 10 hektar store Hohe See ved landsbyen Hohensee. Syd for byen Zemitz findes det 43 meter højeRauhe Berg, der er det højeste punkt i kommunen.