STS-96 (Space Transportation System-96) var Discoverys 26. rumfærge-mission. Den blev opsendt d. 27. maj1999 og vendte tilbage den d. 6. juni1999. Det var den eneste rumflyvning overhovedet til den Internationale Rumstation i 1999, grundet forsinkelsen med det russiske Zvezda-modul. Discovery havde udstyr med til både Zarja- og Unity-modulerne.