Finn Hauberg Mortensen var gennem sin karriere tilknyttet Københavns Universitet og Syddansk Universitet: 1970-1974 på KU, 1991-2007 professor i nordisk litteratur ved SDU og 2007-2012 leder af Institut for Nordiske Studier og Sprogvidenskab ved KU. Han forskede i mange af de største danske forfattere og udgav bøger om blandt andet Søren Kierkegaard og H.C. Andersen. Han deltog også i flere ministerielle udvalg.[2] Hauberg Mortensen var blandt andet formand for litteraturudvalget for Kulturkanonen 2005-06.