Genetisk kode
Den genetiske kode er en fortegnelse over samtlige en arts DNA- og mRNA-tripletter med angivelse af, hvilke aminosyrer de koder for.
Karakteristika:
- Koden er en triplet kode. Tre sammenhængende baser danner et codon og koder for en aminosyre.
- Koden er degenereret, flere codon koder for samme aminosyre.
- Koden er ikke-overlappende, enhver base er kun del af et codon.
- Codonerne i et bestemt gen er i sekvens, der er ingen mellemrum.
- Koden er universel, de samme aminosyrer kodes af de samme codon i næsten alle organismer, der er undersøgt; i mitochondrier og visse protozoa er der mindre afvigelser.
- Rækkefølgen af codon dikterer rækkefølgen af aminosyrer i den polypeptidkæde genet koder for.
- Tre af de 64 codoner er stopkoder (UAA, UAG, UGA). Dannelsen af et polypeptid stopper når disse codon nås.
- Codon AUG (eller GUG) initierer den åbne læseramme i et gen men koder også for methionin, i prokaryoter den afledte aminosyre formylmethionin.
- Koden læses i 5'-3'-retningen.
Standard versionen vises i de følgende tabeller, som viser hvilke aminosyrer hver af de 43 = 64 mulige codon specificerer (Tabel 1), og hvilke codon der bliver specificeret af de 20 aminosyrer der er involveret i translationen (Tabel 2). For eksempel koder GAU for aminosyren Asp (asparagin), og Cys (cystein) kodes af codon UGU og UGC. Dette kaldes forward og reverse codon tabeller, respektive. Baserne i tabellerne nedenfor er adenin, cytosin, guanin og uracil, som bruges i mRNA; i DNA, erstatter thymin uracil.
2. base | |||||
---|---|---|---|---|---|
U | C | A | G | ||
1. base | U |
UUU Phenylalanin |
UGU Cystein | ||
C | |||||
A | |||||
G |
1AUG codon koder både for methionin og tjener som initieringssted; den første AUG i en mRNA's kodnings region vil være stedet, hvor translationen til proteinet begynder.
Ala | GCU, GCC, GCA, GCG | Leu | UUA, UUG, CUU, CUC, CUA,
CUG |
Arg | CGU, CGC, CGA, CGG, AGA,
AGG |
Lys | AAA, AAG |
Asn | AAU, AAC | Met | AUG |
Asp | GAU, GAC | Phe | UUU, UUC |
Cys | UGU, UGC | Pro | CCU, CCC, CCA, CCG |
Gln | CAA, CAG | Ser | UCU, UCC, UCA, UCG, AGU,
AGC |
Glu | GAA, GAG | Thr | ACU, ACC, ACA, ACG |
Gly | GGU, GGC, GGA, GGG | Trp | UGG |
His | CAU, CAC | Tyr | UAU, UAC |
Ile | AUU, AUC, AUA | Val | GUU, GUC, GUA, GUG |
START | AUG, GUG | STOP | UAG, UGA, UAA |
Se også
[redigér | rediger kildetekst]