Klubben blev grundlagt i 1902 under navnet Meidericher SV. I 1905 fusionerede den med SC Viktoria Meidericher under det førstnævnte navn. Først i 1967 skiftede klubben til det nuværende navn.
I 1962 rykkede klubben op i den bedste række, og den blev dermed en af de oprindelige 16 mandskaber i den første Bundesliga. Første sæson var også klubbens mest succesrige, da det blev til en andenplads – en bedrift, der aldrig siden er gentaget. De næste 20 år var Duisburg fast inventar, men i 1983 rykkede den ned og sluttede sig til gruppen af elevatorhold, der består af Arminia Bielefeld, VfL Bochum og FC St. Pauli.