Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages

Fra Wikipedia, den frie encyklopædi
Spring til navigation Spring til søgning
Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages
Pangolin logo.svg
Udgivet 30. april 2020; 12 måneder siden (2020-04-30)
Skrevet i Python
Licens GNU General Public License v3.0
Hjemmeside Pangolin.cog-uk.io
Github : github.com/cov-lineages/pangolin

Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (PANGOLIN eller PANGO Lineages) er et softwareprogram udviklet af medlemmer af COG-UK konsortiet.[1][2]

Programmet giver en bruger mulighed for at tildele en SARS-CoV-2-virusprøve til en eksperimentel stamme ved at sammenligne genomet af testprøven med andre gensekvenser.[3]

Referencer[redigér | redigér wikikode]

  1. ^ Home - COG-UK Consortium: (https://www.cogconsortium.uk/ www.cogconsortium.uk 2021-01-31
  2. ^ Real-Time Epidemiology for COVID-19 , Centre for Genomic Pathogen Surveillance www.pathogensurveillance.net, 2021-01-31 − Software : "... used to assign lineages to SARS-CoV-2 sequences. ..." (tildele linjer/afstamning til SARS-CoV-2-sekvenser / sammenholde 'lineages' med SARS-CoV-2-sekvenser
  3. ^ Pangolin web application release Virological 2020-05-13, læst 2021-01-31, engelsk

Se også[redigér | redigér wikikode]

Eksterne henvisninger[redigér | redigér wikikode]